• 如有疑虑,可邮件fengliushu@126.com索要两节体验,感谢信任!

  • 所有发布都有视频课程提供,如视频被和谐等原因,一律退回购买款项。

  • 请账款时忘记备注网站ID的用户及时站内留言或邮箱联系,感谢!

  • 为啥客人备注了用户名我却找不到呢?点解(⊙o⊙)哇

  • 速!请转款忘记备注ID的小伙伴及时网站留言或微信转款处留言,谢谢!

  • 今天清理了博客内一些不太绿色的内容,特别是标题有点过头的。还是规规矩矩些吧,这样才有未来。

  • 请错误备注id的小伙伴出来认领一下呢,金额及大致时间,谢谢!

网易云课堂《[入门课程]GROMACS快速入门课程》百度云视频课程下载

风流学宫 风流鼠 6个月前 (01-15) 733次浏览 0个评论

网易云课堂《[入门课程]GROMACS快速入门课程》百度云视频课程下载
分享这套网易云课堂《[入门课程]GROMACS快速入门课程》百度云视频课程下载,高清录制MP4格式视频,未添加水印,不限制播放设备。定价48元。
官网链接:https://study.163.com/course/introduction.htm?courseId=1003245003
百度云链接:

查看本段内容需要支付 4800 金币

您尚未登录,请 点击登录 或者 立即注册

适用人群
科研方向以生物、化学分子为研究对象的科研工作者;GROMACS爱好者;分子动力学模拟新手

课程概述
此网络课程引导新手 快速入门【GROMACS 5.1.x】 分子动力学模拟软件;快速建立科研成就感;掌握建模方法,会写mdp文件,知道如何分析数据等;实现在短期内能够上手自己课题。

本课程不按一般培训套路,在操作中讲解基本知识和技能,实现理论和技术的完美结合。

【提醒:5.1.4版本的OPLSAA力场有些问题,建议使用5.0.7的top文件夹覆盖掉5.1.4的share/gromacs下的top文件夹;或者直接用本教程方法安装最新的 gromacs-2016.1 版本(October 28, 2016发布, 已测试没问题);VMD入门级操作请到优酷观看】

【前8章学完一部分,一定要跟着操作完在进行下一部分,不要急于求成;课程参考资料部分会有些资料供大家下载;章节说明会有课程中没解决问题的注意事项说明】

目录
章节1:开场白
课时1开始之前-GMX零基础快速入门04:12
课时2漫谈GROMACS18:46
章节2:安装不求人
课时3GMX安装演示(1)-常用软件14:44
课时4GMX安装演示(2)-fftw安装34:11
课时5GMX安装演示(3)-gmx传送12:23
课时6GMX安装演示(4)-gmx安装27:10
课时7安装问题解决之道11:54
章节3:学一例,通全部【实例前的忠告,以后顺序看】
课时8MD模拟的一般步骤26:25
课时9GMX学习方法22:33
章节4:建模不用愁(实例、全原子力场,问题和对策)
课时10建模第一步-获得 蛋白质 坐标22:06
课时11第一个辅助建模命令33:21
课时12文件格式-gro文件27:44
课时13文件格式-top(1)39:04
课时14文件格式-top(2)27:11
课时15文件格式-top(3)26:51
课时16数据库文件20:04
课时17体系中加水(第二个命令)22:27
课时18盒子中加离子(第三、四个命令)26:03
章节5:结构优化和弛豫(实例-续)
课时19系统能量优化(能量极小化)25:22
课时20NVT模拟23:44
课时21NPT模拟12:28
章节6:MDP和数据收集(实例-续)
课时22NPT模拟-数据采集27:03
课时23例子的最后-如何写MDP文件38:26
章节7:专题-伞状抽样计算PMF(粒子-生物膜 系统)
课时24实例计算PMF(1)-建模、Martini力场31:24
课时25实例计算PMF(2)-Pull模拟、MDP文件48:45
课时26实例计算PMF(3)-伞状抽样、数据分析命令14:13
课时27生物膜模拟资料(力场、分析、建模)
章节8:专题-用pdb2gmx构建非标准残基top文件
课时28pdb2gmx用到的数据库文件介绍13:17
课时29实例演示-修改数据库方法(PAMAM分子)25:43
课时30SpecBond.dat的说明12:47
章节9:专题-建模工具和命令高级篇
课时31gmx genconf 生成大系统30:32
课时32力场生成工具简介14:12
课时33charmm-GUI:膜-蛋白体系建模神器简单介绍22:10
章节10:专题-数据分析方法和命令
课时34数据分析的普适思路17:29
课时35数据处理第一步(建立索引文件)20:31
课时36傻瓜式安装pymol(Linux版)(参考资料可下载)
课时37手册上处理命令锦集(再看手册)21:48
章节11:专题-蛋白kalp-膜dppc教程(全原子)
课时38KALP多肽的处理25:08
课时39itp文件的修改32:21
课时40合并gro文件50:52
课时41删除protein周围的lipid33:14
课时42npt/make_nx/semiistropic

喜欢 (8)
风流鼠
关于作者:
风流鼠,无水印破解网课资源博客管理员。固以正版为尊,因财力不济使然。关于求学:人以不知而为耻,当以求学而为荣。
发表我的评论
取消评论
表情 贴图 加粗 删除线 居中 斜体 签到

Hi,您需要填写昵称和邮箱!

  • 昵称 (必填)
  • 邮箱 (必填)
  • 网址